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納米孔測序
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納米孔測序

Oxford Nanopore開發(fā)的新一代納米孔測序技術(shù),也稱之為“第三代測序”、“單分子實時測序”、“第四代測序”等。


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Oxford Nanopore開發(fā)的新一代納米孔測序技術(shù),也稱之為“第三代測序”、“單分子實時測序”、“第四代測序”等。



上海柏辰生物科技有限公司(Shanghai Bio-chain Co.,Ltd)是英國牛津納米孔公司(Oxford Nanopore)在中國地區(qū)的官方授權(quán)代理商,并獲得官方授權(quán)技術(shù)認(rèn)證。為生命科學(xué)工作者提供專業(yè)的整體技術(shù)解決方案,包括產(chǎn)品咨詢、安裝培訓(xùn)、技術(shù)支持、售后維護(hù)等一站式服務(wù)。

Oxford Nanopore牛津納米孔公司(簡稱“ONT”)成立于 2005 年,總部位于英國牛津,在中國上海和北京設(shè)有辦事處。目前納米孔測序公司擁有超過 1400 項專利,開發(fā)的新一代納米孔測序技術(shù),市場上也稱之為“第三代測序”、“單分子實時測序”、“第四代測序”等,產(chǎn)品已銷往100多個國家和地區(qū)。應(yīng)用于包括人類基因組學(xué)、微生物組學(xué)、動植物基因組學(xué)、全長轉(zhuǎn)錄組學(xué)等,并在醫(yī)療保健、農(nóng)業(yè)、食品和水監(jiān)測以及教育領(lǐng)域提供快速、有意義的信息。

納米孔測序原理

納米孔測序的原理是根據(jù)DNA/RNA分子通過納米孔時產(chǎn)生的特征性電流波動來識別堿基序列,確定DNA或RNA的序列,并同時確定堿基修飾信息。

技術(shù)特點

納米孔測序能為科學(xué)研究者提供以下優(yōu)勢的技術(shù):

1)測序任何長度 DNA/RNA 片段:從短讀長至超長讀長,鑒定更多遺傳變異,應(yīng)用更廣泛多樣

2)直接測序天然 DNA/RNA,生成內(nèi)容豐富的數(shù)據(jù),包括甲基化

3)即刻獲得實時數(shù)據(jù),快速見解和分析,用于實時響應(yīng)的結(jié)果

4)便攜式儀器到超高通量臺式設(shè)備的擴(kuò)展性

5)隨時隨地,測序任何事物測序

6)簡單快速的文庫制備,易用且功能多樣

7)準(zhǔn)確度大于Q20!持續(xù)更新,可關(guān)注:https://nanoporetech.com/accuracy

產(chǎn)品和應(yīng)用

所有納米孔測序設(shè)備均使用相同的核心技術(shù),使其易于根據(jù)應(yīng)用擴(kuò)展規(guī)模,選擇合適型號的儀器。便攜式MinION MK1C、中高通量GridION MK1、高通量PromethION儀器,滿足不同場景、不同應(yīng)用的納米孔長讀長實時測序需求。 

MinION MK1C整合高性能計算和高分辨率屏幕,是一款功能強(qiáng)大、全方位集成的便捷式納米孔測序儀。

允許您在任何地點——從工作臺到實地——對任何生物進(jìn)行測序,實時分析,提供即時且有效的結(jié)果。

特點:

1)便攜式:450g;體機(jī)高 30 mm ,寬 140 mm, 長 114 mm;

2)運行單張芯片,獲得高達(dá)10-30 Gb(理論上最高可達(dá)40 Gb);

3)適合快速宏基因組物種鑒定和抗微生物抗藥性分析,準(zhǔn)確的高覆蓋微生物基因組組裝(DNA和RNA),靶基因測序,全長轉(zhuǎn)錄組測序等;

GridION MK1: 面向?qū)嶒炇业母咄?、實時、按需測序

能夠同時或單獨運行五個測序芯片,使繁忙的實驗室和服務(wù)提供商能夠極具成本效益地受益于長讀長、實時納米孔測序的優(yōu)勢。集成高性能數(shù)據(jù)處理減少了對復(fù)雜IT基礎(chǔ)設(shè)施的需要。

特點:

1)高通量、實時、按需測序;

2)獨立運行5張芯片,最高產(chǎn)生150Gb數(shù)據(jù);

3)適合多個樣本分析,靈活測序全基因組、宏基因組、靶向區(qū)域和全長RNA轉(zhuǎn)錄本等

PromethION 是一款最高通量、大容量測序設(shè)備,使人類基因組測序的成本降至不到1000美元。

PromethION 24 (P24)和 PromethION 48 (P48) 設(shè)計的運行分別多達(dá)24和48個PromethION大芯片,每個測序芯片產(chǎn)出高達(dá)200 Gb,滿載運行分別能夠產(chǎn)生4Tb和10Tb的數(shù)據(jù)。芯片“并聯(lián)”式設(shè)計,能夠獨立運行,提供靈活的按需測序,以滿足特定的實驗需求。

特點:

1)高通量、極具測序成本效益;

2)適用于高通量微生物測序、人類基因組測序、腫瘤基因組學(xué)、遺傳病理研究、RNA全長測序、動植物基因組等


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