技術(shù)服務(wù)部
Technical Service Department
上海柏辰生物數(shù)字PCR技術(shù)服務(wù)——真正的高靈敏度微滴式數(shù)字PCR
QX200? Droplet Digital? PCR系統(tǒng)
微滴式數(shù)字PCR——Bio-Rad公司的QX200 PCR系統(tǒng)是能夠直接精準(zhǔn)記錄DNA分子個數(shù)的第三代PCR。其原理是將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成上萬個微滴,每個微滴都是一個獨立的PCR反應(yīng)體系,PCR反應(yīng)后對每個微滴的熒光信號進(jìn)行檢測,最終用專用分析軟件計算出待檢測樣品的絕對定量值。
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液態(tài)活檢——游離DNA檢測 | 拷貝數(shù)變異分析 | 稀有突變檢測 | 二代測序結(jié)果的精準(zhǔn)驗證 |
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低豐度病原微生物檢測 | 轉(zhuǎn)基因成分鑒定分析 | 微小差異基因或單細(xì)胞基因表達(dá)分析 |
● 痕量檢出
單分子水平擴(kuò)增,微量DNA熒光信號不再被覆蓋。
● 絕對定量
直接提供濃度值(copeis/ul),不依賴擴(kuò)增曲線、標(biāo)準(zhǔn)品。
● 高靈敏度
靈敏度高達(dá)0.001%。
● 高精確度
終點讀取熒光信號,可區(qū)分1.1倍差異。
● 高穩(wěn)定性
受抑制劑影響很小,CV值小于5%。
突變檢測
Guo QM, Wang L, Yu WJ, Qiao LH, Zhao MN, Hu XM, Sun YM, Ni S, Xu YH, Lou JT. Detection of Plasma EGFR Mutations in NSCLC Patients with a Validated ddPCR Lung cfDNA Assay [J]. J Cancer, 2019, 10(18):4341-4349.
◆ 建立肺癌靶向用藥伴隨診斷檢測體系。
◆ 體系靈敏度低至0.1%。
定量檢測
Xunhua Zhu, Pengcheng Liu , Lijuan Lu , Huaqing Zhong , Menghua Xu , Ran Jia , Liyun Su , Lingfeng Cao , Yameng Sun , Meijun Guo , Jianyue Sun , Jin Xu. Development of a multiplex droplet digital PCR assay for detection of enterovirus, parechovirus, herpes simplex virus 1 and 2 simultaneously for diagnosis of viral CNS infections [J]. Virol J, 2022, 19(1):70.
◆ 腦脊液樣本中痕量拷貝病原感染檢測。
◆ 建立數(shù)字PCR四重檢測體系。
基因 | 檢測內(nèi)容 | 臨床診斷 |
AR-V7 | ar-v7剪切變異表達(dá) | 前列腺癌 |
EGFR | 19del(57種)、L858R、T790M、L861Q、G719S、S768I、G719X | 肺癌等 |
20ins【V769_D770insASV、D770_N771insG、H773_V774insNPH、N771_H773dup、D770_N771insSVD、S768_D770dup、A763_Y764insFQEA、H773_V774insH】 | ||
T790M-C797S順反式 | ||
ALK | EML4-ALK(cDNA):E13A20 | 肺癌等 |
EML4-ALK(cDNA):E20A20 | ||
EML4-ALK(cDNA):E6A20 | ||
BRAF | V600E | 黑色素瘤等 |
ERBB2(HER2) | CNV | 乳腺癌、胃癌等 |
KRAS | G12D、G12A、G12V、G12C、G12R、G12S、G13D、Q61H、Q61L等 | 肺癌、大腸癌等 |
MET | CNV | 肺癌等 |
PIK3CA | E545K、E542K、H1047R等 | 乳腺癌、卵巢癌等 |
其余可檢測易感基因(液態(tài)活檢):AKT1、ATM、BRCA1、BRCA2、CCDC6-RET融合、C-KIT、CD74-ROS1、CHEK1、EML4-ALK融合、ERBB2、FGFR3、FRY、IDH1、MET、NRAS、PALB2、PDGFRA、RAD51C、RAD54L、SLC34A2(E4)-ROS1(E32)、TP53TPM3-NTRK1融合等相關(guān)突變位點。