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技術(shù)服務(wù)部

Technical Service Department

數(shù)字PCR技術(shù)服務(wù)介紹

上海柏辰生物數(shù)字PCR技術(shù)服務(wù)——真正的高靈敏度微滴式數(shù)字PCR


QX200? Droplet Digital? PCR系統(tǒng)


  微滴式數(shù)字PCR——Bio-Rad公司的QX200 PCR系統(tǒng)是能夠直接精準(zhǔn)記錄DNA分子個數(shù)的第三代PCR。其原理是將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成上萬個微滴,每個微滴都是一個獨立的PCR反應(yīng)體系,PCR反應(yīng)后對每個微滴的熒光信號進(jìn)行檢測,最終用專用分析軟件計算出待檢測樣品的絕對定量值。



服務(wù)項目

液態(tài)活檢——游離DNA檢測拷貝數(shù)變異分析稀有突變檢測二代測序結(jié)果的精準(zhǔn)驗證

低豐度病原微生物檢測轉(zhuǎn)基因成分鑒定分析

微小差異基因或單細(xì)胞基因表達(dá)分析



技術(shù)優(yōu)勢

● 痕量檢出

單分子水平擴(kuò)增,微量DNA熒光信號不再被覆蓋。

● 絕對定量

直接提供濃度值(copeis/ul),不依賴擴(kuò)增曲線、標(biāo)準(zhǔn)品。

● 高靈敏度

靈敏度高達(dá)0.001%。

● 高精確度

終點讀取熒光信號,可區(qū)分1.1倍差異。

● 高穩(wěn)定性

受抑制劑影響很小,CV值小于5%。


上海柏辰已發(fā)表部分文章展示

突變檢測

Guo QM, Wang L, Yu WJ, Qiao LH, Zhao MN, Hu XM, Sun YM, Ni S, Xu YH, Lou JT. Detection of Plasma EGFR Mutations in NSCLC Patients with a Validated ddPCR Lung cfDNA Assay [J]. J Cancer, 2019, 10(18):4341-4349.

◆ 建立肺癌靶向用藥伴隨診斷檢測體系。

◆ 體系靈敏度低至0.1%。


定量檢測

Xunhua Zhu, Pengcheng Liu , Lijuan Lu , Huaqing Zhong , Menghua Xu , Ran Jia , Liyun Su , Lingfeng Cao , Yameng Sun , Meijun Guo , Jianyue Sun , Jin Xu. Development of a multiplex droplet digital PCR assay for detection of enterovirus, parechovirus, herpes simplex virus 1 and 2 simultaneously for diagnosis of viral CNS infections [J]. Virol J, 2022, 19(1):70.

◆ 腦脊液樣本中痕量拷貝病原感染檢測。

◆ 建立數(shù)字PCR四重檢測體系。


基因

檢測內(nèi)容

臨床診斷

AR-V7

ar-v7剪切變異表達(dá)

前列腺癌

EGFR

19del(57種)、L858R、T790M、L861Q、G719S、S768I、G719X

肺癌等

20ins【V769_D770insASV、D770_N771insG、H773_V774insNPH、N771_H773dup、D770_N771insSVD、S768_D770dup、A763_Y764insFQEA、H773_V774insH】

T790M-C797S順反式

ALK

EML4-ALK(cDNA):E13A20

肺癌等

EML4-ALK(cDNA):E20A20

EML4-ALK(cDNA):E6A20

BRAF

V600E

黑色素瘤等

ERBB2(HER2)

CNV

乳腺癌、胃癌等

KRAS

G12D、G12A、G12V、G12C、G12R、G12S、G13D、Q61H、Q61L等

肺癌、大腸癌等

MET

CNV

肺癌等

PIK3CA

E545K、E542K、H1047R等

乳腺癌、卵巢癌等

其余可檢測易感基因(液態(tài)活檢):AKT1、ATM、BRCA1、BRCA2、CCDC6-RET融合、C-KIT、CD74-ROS1、CHEK1、EML4-ALK融合、ERBB2、FGFR3、FRY、IDH1、MET、NRAS、PALB2、PDGFRA、RAD51C、RAD54L、SLC34A2(E4)-ROS1(E32)、TP53TPM3-NTRK1融合等相關(guān)突變位點。